Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ80

Nif3l1, NIF3-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nif3l1Q9EQ80 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Nif3l1Q9EQ80 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC22.24■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.15
Nif3l1Q9EQ80 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Nif3l1Q9EQ80 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.4 ms