Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Mprip-204ENSMUST00000116371 8766 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
V1ra8Q9EQ48 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
V1ra8Q9EQ48 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
V1ra8Q9EQ48 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
V1ra8Q9EQ48 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
V1ra8Q9EQ48 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
V1ra8Q9EQ48 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
V1ra8Q9EQ48 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Zfp131-205ENSMUST00000223812 663 ntBASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
V1ra8Q9EQ48 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
V1ra8Q9EQ48 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.4 ms