Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ00

Ropn1l, Ropporin-1-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 218 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ropn1lQ9EQ00 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ropn1lQ9EQ00 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ropn1lQ9EQ00 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ropn1lQ9EQ00 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ropn1lQ9EQ00 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Ropn1lQ9EQ00 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ropn1lQ9EQ00 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
Ropn1lQ9EQ00 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.89■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.88■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
Ropn1lQ9EQ00 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.82■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
Ropn1lQ9EQ00 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
Ropn1lQ9EQ00 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.7 ms