Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPQ2

Rpgrip1, X-linked retinitis pigmentosa GTPase regulator-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,331 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpgrip1Q9EPQ2 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC35.11■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC35.1■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC35.09■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC35.08■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC35.07■■■■□ 3.21
Rpgrip1Q9EPQ2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.07■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.06■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC35.06■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC35.05■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Srp9-201ENSMUST00000027792 1367 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.04■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC35.03■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC35.03■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC35.02■■■■□ 3.2
Rpgrip1Q9EPQ2 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC35■■■■□ 3.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.99■■■■□ 3.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC34.98■■■■□ 3.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.97■■■■□ 3.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Six5-201ENSMUST00000049454 3007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC34.96■■■■□ 3.19
Rpgrip1Q9EPQ2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.95■■■■□ 3.19
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC34.94■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC34.93■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC34.92■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC34.92■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC34.91■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.91■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.9■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC34.89■■■■□ 3.18
Rpgrip1Q9EPQ2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.88■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC34.87■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.87■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.86■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.85■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.83■■■■□ 3.17
Rpgrip1Q9EPQ2 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC34.82■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC34.81■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.8■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.79■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.78■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.77■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC34.76■■■■□ 3.16
Rpgrip1Q9EPQ2 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.76■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.75■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC34.75■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC34.74■■■■□ 3.15
Rpgrip1Q9EPQ2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.74■■■■□ 3.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms