Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPK2

Rp2, Protein XRP2, mousemouse

Predictions only

Length 347 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rp2Q9EPK2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC20.12■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Rab4b-201ENSMUST00000093040 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Rp2Q9EPK2 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Slc30a2-203ENSMUST00000105873 1224 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20.04■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Rp2Q9EPK2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Rp2Q9EPK2 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.6 ms