Protein–RNA interactions for Protein: Q9EPC1

Parva, Alpha-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 372 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvaQ9EPC1 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
ParvaQ9EPC1 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
ParvaQ9EPC1 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
ParvaQ9EPC1 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ParvaQ9EPC1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.3 ms