Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCR2

Ap3s1, AP-3 complex subunit sigma-1, mousemouse

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3s1Q9DCR2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 BC030336-205ENSMUST00000208454 813 ntTSL 2 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Ap3s1Q9DCR2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Junos-204ENSMUST00000128094 830 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Gm42984-201ENSMUST00000195990 987 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Ap3s1Q9DCR2 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Ap3s1Q9DCR2 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Ap3s1Q9DCR2 Psme4-201ENSMUST00000041231 6491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3s1Q9DCR2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3s1Q9DCR2 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3s1Q9DCR2 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3s1Q9DCR2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3s1Q9DCR2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3s1Q9DCR2 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Ap3s1Q9DCR2 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC19.93■□□□□ 0.78
Ap3s1Q9DCR2 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms