Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBU3

Riok3, Serine/threonine-protein kinase RIO3, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 519 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Riok3Q9DBU3 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Gm28196-201ENSMUST00000187719 640 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Riok3Q9DBU3 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Il4-203ENSMUST00000140684 530 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Il4-204ENSMUST00000150568 605 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Isg20-201ENSMUST00000038142 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Il4-201ENSMUST00000000889 590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Gm44882-201ENSMUST00000205702 802 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.39■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Riok3Q9DBU3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Gm45609-204ENSMUST00000209837 1207 ntTSL 5 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Riok3Q9DBU3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Riok3Q9DBU3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.3 ms