Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBM0

Abcg8, ATP-binding cassette sub-family G member 8, mousemouse

Predictions only

Length 673 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Abcg8Q9DBM0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Abcg8Q9DBM0 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Abcg8Q9DBM0 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.33■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Abcg8Q9DBM0 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcg8Q9DBM0 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcg8Q9DBM0 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcg8Q9DBM0 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcg8Q9DBM0 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcg8Q9DBM0 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcg8Q9DBM0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcg8Q9DBM0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Abcg8Q9DBM0 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcg8Q9DBM0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Abcg8Q9DBM0 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.3 ms