Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB40

Med27, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 27, mousemouse

Predictions only

Length 311 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med27Q9DB40 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med27Q9DB40 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med27Q9DB40 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.16■□□□□ 0.98
Med27Q9DB40 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.16■□□□□ 0.98
Med27Q9DB40 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med27Q9DB40 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med27Q9DB40 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med27Q9DB40 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med27Q9DB40 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Med27Q9DB40 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.14■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.12■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Med27Q9DB40 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.07■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.03■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.02■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Med27Q9DB40 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC20.99■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Med27Q9DB40 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
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