Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB34

Chmp2a, Charged multivesicular body protein 2a, mousemouse

Predictions only

Length 222 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp2aQ9DB34 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Chmp2aQ9DB34 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Chmp2aQ9DB34 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Chmp2aQ9DB34 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.31
Chmp2aQ9DB34 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.19■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Chmp2aQ9DB34 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms