Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAA3

Uncharacterized protein C4orf36 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 117 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAA3 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
Q9DAA3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Noc2l-202ENSMUST00000179886 2813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Maml1-201ENSMUST00000059458 5528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Phf14-201ENSMUST00000090632 3985 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Q9DAA3 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Agfg1-202ENSMUST00000113444 3142 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Bnc2-214ENSMUST00000176612 3963 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Cbx6-203ENSMUST00000109627 5806 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Arid1b-201ENSMUST00000092723 7150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Tmtc1-201ENSMUST00000060095 8383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Amdhd1-201ENSMUST00000016034 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Q9DAA3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Acsl3-203ENSMUST00000134566 2492 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Tmtc1-202ENSMUST00000100772 8269 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Carm1-202ENSMUST00000115394 3320 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 6430573P05Rik-203ENSMUST00000195547 2457 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.36■□□□□ 0.21
Q9DAA3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.36■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.8 ms