Protein–RNA interactions for Protein: Q9D9Z7

Subh2bv, Histone H2B subacrosomal variant, mousemouse

Predictions only

Length 123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Subh2bvQ9D9Z7 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Subh2bvQ9D9Z7 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Subh2bvQ9D9Z7 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC21.86■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC21.83■■□□□ 1.09
Subh2bvQ9D9Z7 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Subh2bvQ9D9Z7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
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