Protein–RNA interactions for Protein: Q9D915

Tcim, Transcriptional and immune response regulator, mousemouse

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Length 106 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TcimQ9D915 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TcimQ9D915 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TcimQ9D915 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
TcimQ9D915 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.97■■□□□ 1.11
TcimQ9D915 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
TcimQ9D915 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.94■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.1
TcimQ9D915 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.86■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
TcimQ9D915 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.82■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.8■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.78■■□□□ 1.08
TcimQ9D915 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.2 ms