Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8S4

Rexo2, Oligoribonuclease, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rexo2Q9D8S4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Rexo2Q9D8S4 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Rexo2Q9D8S4 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Rexo2Q9D8S4 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Rexo2Q9D8S4 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Rexo2Q9D8S4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms