Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8K3

Derl3, Derlin-3, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Derl3Q9D8K3 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.44■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.43■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC19.43■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.43■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC19.42■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.42■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.41■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.41■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC19.4■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.4■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC19.4■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.7
Derl3Q9D8K3 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC19.39■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.39■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.38■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.38■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC19.37■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.37■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.37■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.36■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.35■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC19.34■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.34■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC19.33■□□□□ 0.69
Derl3Q9D8K3 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC19.33■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC19.32■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.32■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC19.31■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC19.31■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.3■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC19.3■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC19.3■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.29■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.29■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 BC037032-205ENSMUST00000187080 508 ntTSL 5 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.28■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.28■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.27■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.68
Derl3Q9D8K3 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.27■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.26■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.26■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC19.25■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.25■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC19.24■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.24■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.23■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Derl3Q9D8K3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.23■□□□□ 0.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms