Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8B3

Chmp4b, Charged multivesicular body protein 4b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 224 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Chmp4bQ9D8B3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.3■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC28.29■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.28■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.27■■■□□ 2.12
Chmp4bQ9D8B3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.26■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC28.25■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC28.24■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.23■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC28.22■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.21■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC28.2■■■□□ 2.11
Chmp4bQ9D8B3 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC28.2■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.19■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.18■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.17■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC28.16■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.15■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.14■■■□□ 2.1
Chmp4bQ9D8B3 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.13■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.12■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC28.11■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.1■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC28.09■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.08■■■□□ 2.09
Chmp4bQ9D8B3 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.07■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Tmem150a-202ENSMUST00000132243 1478 ntTSL 5 BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.06■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.04■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.03■■■□□ 2.08
Chmp4bQ9D8B3 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.02■■■□□ 2.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms