Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Z1

Nop56, Nucleolar protein 56, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 580 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nop56Q9D6Z1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Nop56Q9D6Z1 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Nop56Q9D6Z1 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC23■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Nop56Q9D6Z1 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop56Q9D6Z1 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop56Q9D6Z1 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop56Q9D6Z1 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Nop56Q9D6Z1 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop56Q9D6Z1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop56Q9D6Z1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Nop56Q9D6Z1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.4 ms