Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Z5

Prame, Preferentially-expressed antigen in melanoma, mousemouse

Predictions only

Length 464 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrameQ9D4Z5 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
PrameQ9D4Z5 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.33■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
PrameQ9D4Z5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
PrameQ9D4Z5 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
PrameQ9D4Z5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
PrameQ9D4Z5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms