Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4Q1

Ribc2, RIB43A-like with coiled-coils protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 309 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ribc2Q9D4Q1 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.99
Ribc2Q9D4Q1 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC21.2■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Pdcd4-203ENSMUST00000165617 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC21.15■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
Ribc2Q9D4Q1 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.13■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.12■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.11■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Ribc2Q9D4Q1 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.07■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.06■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.06■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.05■□□□□ 0.96
Ribc2Q9D4Q1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.04■□□□□ 0.96
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73 ms