Protein–RNA interactions for Protein: Q9D495

Syce1, Synaptonemal complex central element protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 329 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syce1Q9D495 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.73■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.72■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.72■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.71■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.71■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.55
Syce1Q9D495 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC24.7■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Syce1Q9D495 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Syce1Q9D495 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.54■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syce1Q9D495 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.5 ms