Protein–RNA interactions for Protein: Q9D439

Cfap53, Cilia- and flagella-associated protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 514 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cfap53Q9D439 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Cfap53Q9D439 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Cfap53Q9D439 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Cfap53Q9D439 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Cfap53Q9D439 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.1 ms