Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3Z8

4933425L06Rik, RIKEN cDNA 4933425L06, mousemouse

Predictions only

Length 585 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
4933425L06RikQ9D3Z8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
4933425L06RikQ9D3Z8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
4933425L06RikQ9D3Z8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
4933425L06RikQ9D3Z8 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
4933425L06RikQ9D3Z8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms