Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3P1

Tchhl1, Trichohyalin-like protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 638 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tchhl1Q9D3P1 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Tchhl1Q9D3P1 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Tchhl1Q9D3P1 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Tchhl1Q9D3P1 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.39■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.39■■□□□ 1.18
Tchhl1Q9D3P1 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Tchhl1Q9D3P1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.3 ms