Protein–RNA interactions for Protein: Q9D384

Snrnp35, U11/U12 small nuclear ribonucleoprotein 35 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snrnp35Q9D384 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Snrnp35Q9D384 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC25.26■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC25.24■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.23■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.21■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.63
Snrnp35Q9D384 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.2■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.19■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.18■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.17■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC25.16■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.16■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.15■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC25.14■■□□□ 1.62
Snrnp35Q9D384 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.14■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.13■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.12■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.11■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.1■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.09■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC25.08■■□□□ 1.61
Snrnp35Q9D384 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.08■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Snrnp35Q9D384 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.07■■□□□ 1.6
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 56.9 ms