Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2N9

Vps33a, Vacuolar protein sorting-associated protein 33A, mousemouse

Predictions only

Length 598 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps33aQ9D2N9 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps33aQ9D2N9 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps33aQ9D2N9 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Gm24804-201ENSMUST00000174982 85 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps33aQ9D2N9 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Mapk13-201ENSMUST00000004986 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Srp9-202ENSMUST00000111018 823 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps33aQ9D2N9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.78■■□□□ 1.4
Vps33aQ9D2N9 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.77■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42 ms