Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2F1

Pramef12, PRAME family member 12, mousemouse

Predictions only

Length 463 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pramef12Q9D2F1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pramef12Q9D2F1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pramef12Q9D2F1 AC093043.1-201ENSMUST00000226700 898 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Gm2415-202ENSMUST00000134688 401 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Becn1-216ENSMUST00000170502 725 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Dexi-201ENSMUST00000038281 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pramef12Q9D2F1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 AC166358.2-201ENSMUST00000223403 734 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Htatsf1-202ENSMUST00000114751 1128 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pramef12Q9D2F1 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pramef12Q9D2F1 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 61.5 ms