Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C9

Snapc3, snRNA-activating protein complex subunit 3, mousemouse

Predictions only

Length 407 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snapc3Q9D2C9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC20.21■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Snapc3Q9D2C9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC20.2■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Pom121-201ENSMUST00000111171 5580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Snapc3Q9D2C9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snapc3Q9D2C9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snapc3Q9D2C9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snapc3Q9D2C9 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snapc3Q9D2C9 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snapc3Q9D2C9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snapc3Q9D2C9 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snapc3Q9D2C9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.5 ms