Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2C2

Saal1, Protein SAAL1, mousemouse

Predictions only

Length 474 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Saal1Q9D2C2 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Saal1Q9D2C2 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
Saal1Q9D2C2 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Saal1Q9D2C2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Saal1Q9D2C2 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Saal1Q9D2C2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Saal1Q9D2C2 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Saal1Q9D2C2 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Saal1Q9D2C2 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.39■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Saal1Q9D2C2 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Saal1Q9D2C2 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC25.3■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.29■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC25.28■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.27■■□□□ 1.64
Saal1Q9D2C2 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.26■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.25■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.25■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.24■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.23■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.23■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.22■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Saal1Q9D2C2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC25.22■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.7 ms