Protein–RNA interactions for Protein: Q9D2A5

Creb3l4, Cyclic AMP-responsive element-binding protein 3-like protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 370 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Creb3l4Q9D2A5 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Creb3l4Q9D2A5 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Creb3l4Q9D2A5 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Creb3l4Q9D2A5 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Creb3l4Q9D2A5 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22■■□□□ 1.11
Creb3l4Q9D2A5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms