Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Vps28Q9D1C8 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps28Q9D1C8 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps28Q9D1C8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Vps28Q9D1C8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Vps28Q9D1C8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Vps28Q9D1C8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC22.85■■□□□ 1.25
Vps28Q9D1C8 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.5 ms