Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Syf2Q9D198 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC23.46■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Syf2Q9D198 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Usp39-201ENSMUST00000070345 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Syf2Q9D198 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Syf2Q9D198 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Rbfox3-206ENSMUST00000120061 2150 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Hnrnpab-201ENSMUST00000074669 2370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Syf2Q9D198 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.6 ms