Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.33■■□□□ 1.01
Tmem53Q9D0Z3 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.31■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC21.29■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Gmeb1-202ENSMUST00000105964 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.27■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Tmem53Q9D0Z3 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Arl8a-201ENSMUST00000027684 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Anxa5-201ENSMUST00000029266 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC21.25■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.22■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.21■□□□□ 0.99
Tmem53Q9D0Z3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Tmem53Q9D0Z3 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 78.9 ms