Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0P8

Ift27, Intraflagellar transport protein 27 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ift27Q9D0P8 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC20,56■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,55■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,54■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,53■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC20,53■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC20,52■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC20,52■□□□□ 0,88
Ift27Q9D0P8 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20,52■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,51■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,5■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC20,49■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC20,49■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,48■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC20,47■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,46■□□□□ 0,87
Ift27Q9D0P8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20,45■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,44■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,43■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC20,42■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20,42■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,41■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC20,41■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,4■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20,39■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,86
Ift27Q9D0P8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Ift27Q9D0P8 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC20,39■□□□□ 0,85
Ift27Q9D0P8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20,39■□□□□ 0,85
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88,7 ms