Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0A3

Arpin, Arpin, mousemouse

Predictions only

Length 226 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ArpinQ9D0A3 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Hdac3-201ENSMUST00000043498 2004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.3■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
ArpinQ9D0A3 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.27■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
ArpinQ9D0A3 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
ArpinQ9D0A3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
ArpinQ9D0A3 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArpinQ9D0A3 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArpinQ9D0A3 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArpinQ9D0A3 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArpinQ9D0A3 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArpinQ9D0A3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArpinQ9D0A3 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
ArpinQ9D0A3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.2 ms