Protein–RNA interactions for Protein: Q9D024

Ccdc47, Coiled-coil domain-containing protein 47, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 483 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc47Q9D024 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Ccdc47Q9D024 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.32■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.31■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.3■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC26.29■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC26.28■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.27■■□□□ 1.8
Ccdc47Q9D024 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.26■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Ccdc47Q9D024 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Ccdc47Q9D024 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Ccdc47Q9D024 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
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