Protein–RNA interactions for Protein: Q9CYY7

Prelid3b, PRELI domain containing protein 3B, mousemouse

Predictions only

Length 195 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prelid3bQ9CYY7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC21.58■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Prelid3bQ9CYY7 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.55■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Prelid3bQ9CYY7 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Prelid3bQ9CYY7 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Prelid3bQ9CYY7 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.5 ms