Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXT8

Pmpcb, Mitochondrial-processing peptidase subunit beta, mousemouse

Predictions only

Length 489 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PmpcbQ9CXT8 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
PmpcbQ9CXT8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC23.22■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.22■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC23.21■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
PmpcbQ9CXT8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.18■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PmpcbQ9CXT8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PmpcbQ9CXT8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.5 ms