Protein–RNA interactions for Protein: Q9CXL1

Tmem50a, Transmembrane protein 50A, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem50aQ9CXL1 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Fam92a-202ENSMUST00000108285 1639 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Etfa-201ENSMUST00000034866 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Ajap1-201ENSMUST00000105646 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Tmem50aQ9CXL1 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Ubtf-201ENSMUST00000006754 3213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Atpaf1-203ENSMUST00000176047 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Tmem50aQ9CXL1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.11■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Slc22a17-210ENSMUST00000228495 2340 ntAPPRIS P1 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Tmem50aQ9CXL1 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC18.09■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms