Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
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