Protein–RNA interactions for Protein: Q9CX97

Wdr55, WD repeat-containing protein 55, mousemouse

Predictions only

Length 388 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Wdr55Q9CX97 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Wdr55Q9CX97 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.78■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Wdr55Q9CX97 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC21.77■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Cadm1-210ENSMUST00000214542 899 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Wdr55Q9CX97 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Wdr55Q9CX97 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.5 ms