Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWU0

Tdrd12, Putative ATP-dependent RNA helicase TDRD12, mousemouse

Predictions only

Length 1,215 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tdrd12Q9CWU0 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tdrd12Q9CWU0 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Gipc1-201ENSMUST00000019577 1522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Arpc2-203ENSMUST00000113820 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tdrd12Q9CWU0 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Plpp2-204ENSMUST00000166804 1566 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Dync1i1-203ENSMUST00000115556 2718 ntTSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tdrd12Q9CWU0 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tdrd12Q9CWU0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.5 ms