Protein–RNA interactions for Protein: Q9CWT3

Snx10, Sorting nexin-10, mousemouse

Predictions only

Length 201 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snx10Q9CWT3 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Snx10Q9CWT3 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx10Q9CWT3 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Snx10Q9CWT3 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Snx10Q9CWT3 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Snx10Q9CWT3 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
Snx10Q9CWT3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Snx10Q9CWT3 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms