Protein–RNA interactions for Protein: Q9CV28

MINDY3, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase MINDY-3, mousemouse

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Length 444 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MINDY3Q9CV28 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
MINDY3Q9CV28 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC21.44■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC21.44■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Henmt1-201ENSMUST00000059946 1998 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
MINDY3Q9CV28 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.34■■□□□ 1.01
MINDY3Q9CV28 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC21.32■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC21.32■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC21.32■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
MINDY3Q9CV28 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
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