Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSB4

Pard3b, Partitioning defective 3 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 1,203 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pard3bQ9CSB4 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pard3bQ9CSB4 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Pard3bQ9CSB4 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pard3bQ9CSB4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pard3bQ9CSB4 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pard3bQ9CSB4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pard3bQ9CSB4 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Pard3bQ9CSB4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Pard3bQ9CSB4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.55■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Pard3bQ9CSB4 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Pard3bQ9CSB4 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms