Protein–RNA interactions for Protein: Q9CRC3

UPF0235 protein C15orf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 126 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CRC3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Rab21-202ENSMUST00000218831 843 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Pabpn1-201ENSMUST00000022808 1030 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Ino80b-202ENSMUST00000113935 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRC3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Q9CRC3 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CRC3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Gm15043-201ENSMUST00000118843 1543 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Fezf2-201ENSMUST00000022262 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CRC3 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Gm10616-201ENSMUST00000205285 2127 ntBASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Drap1-203ENSMUST00000113674 939 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Q9CRC3 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Fam122a-201ENSMUST00000099556 855 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Porcn-204ENSMUST00000089403 1854 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
Q9CRC3 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Q9CRC3 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC17.88■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms