Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQT5

Pomp, Proteasome maturation protein, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PompQ9CQT5 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Gm6934-201ENSMUST00000194780 1905 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
PompQ9CQT5 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
PompQ9CQT5 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Olfm2-203ENSMUST00000215999 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC21.95■■□□□ 1.11
PompQ9CQT5 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Smarcc2-205ENSMUST00000218228 603 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Fancf-201ENSMUST00000169357 1691 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Rbm45-201ENSMUST00000046389 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
PompQ9CQT5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.2 ms