Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ8

Ndufb9, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 beta subcomplex subunit 9, mousemouse

Predictions only

Length 179 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufb9Q9CQJ8 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Dbp-201ENSMUST00000080885 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Ndufb9Q9CQJ8 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Prr5-202ENSMUST00000171460 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.67■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 E130304I02Rik-202ENSMUST00000187873 696 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Gas1-202ENSMUST00000223933 1155 ntAPPRIS P2 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Srd5a3-201ENSMUST00000031143 1747 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ndufb9Q9CQJ8 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Mir6538-201ENSMUST00000183713 110 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Tmem11-201ENSMUST00000062677 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ndufb9Q9CQJ8 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.2 ms