Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQJ1

Higd2a, HIG1 domain family member 2A, mousemouse

Predictions only

Length 106 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Higd2aQ9CQJ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16,03■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16,03■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,03■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,16
Higd2aQ9CQJ1 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16,02■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC16,02■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Ube2k-203ENSMUST00000201266 1449 ntTSL 5 BASIC16,02■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Gm21989-201ENSMUST00000174530 1609 ntTSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC16,01■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16,01■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Gm20208-202ENSMUST00000219905 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Pdpk1-203ENSMUST00000115407 1730 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC15,99■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC15,99■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC15,99■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC15,99■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC15,99■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC15,98■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC15,98■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,98■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC15,97■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Oaz2-206ENSMUST00000153700 1843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,96■□□□□ 0,15
Higd2aQ9CQJ1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC15,95■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,95■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,94■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC15,93■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC15,93■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15,93■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC15,93■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,92■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC15,92■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15,92■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15,91■□□□□ 0,14
Higd2aQ9CQJ1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15,91■□□□□ 0,14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42,1 ms