Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQF4

Uncharacterized protein C6orf203 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9CQF4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Dbndd2-202ENSMUST00000069385 1658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Dnajc21-201ENSMUST00000136591 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQF4 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Gng12-204ENSMUST00000114225 1876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9CQF4 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
Q9CQF4 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Npas1-201ENSMUST00000002053 2091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Gm4419-202ENSMUST00000226239 1431 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Vmac-201ENSMUST00000067931 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Jmjd6-201ENSMUST00000047616 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQF4 A230020J21Rik-202ENSMUST00000192407 1649 ntTSL 2 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Q9CQF4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.57■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQF4 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Rnf39-201ENSMUST00000040498 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQF4 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Mppe1-201ENSMUST00000073054 2007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Tmem9b-201ENSMUST00000033333 1703 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Atp5j-201ENSMUST00000023608 809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQF4 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Q9CQF4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Q9CQF4 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Aars-201ENSMUST00000034441 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Acvr2b-201ENSMUST00000035093 1729 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Kctd2-201ENSMUST00000103035 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Gm26533-201ENSMUST00000180550 1790 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQF4 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.49■□□□□ 0.87
Q9CQF4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms