Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQE8

RTRAF, RNA transcription, translation and transport factor protein, mousemouse

Predictions only

Length 244 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RTRAFQ9CQE8 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 A330041J22Rik-201ENSMUST00000150367 1825 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Sys1-201ENSMUST00000072452 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Trim71-201ENSMUST00000111816 9332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Syndig1l-204ENSMUST00000222422 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Wnk2-204ENSMUST00000110096 6534 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Wnt5b-203ENSMUST00000119369 2339 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Scn1b-201ENSMUST00000098548 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 Gm42699-201ENSMUST00000198104 1657 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
RTRAFQ9CQE8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Xylt1-201ENSMUST00000032892 9020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Atrn-201ENSMUST00000028781 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Dazap1-202ENSMUST00000105361 1537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Lrrc14-201ENSMUST00000036423 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Tmpo-203ENSMUST00000092219 1854 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Purb-201ENSMUST00000179343 8319 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Vstm2l-201ENSMUST00000109523 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Gorasp2-205ENSMUST00000133432 1941 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Ank1-202ENSMUST00000084038 8147 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Gm10499-202ENSMUST00000174778 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.21■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Wnk2-201ENSMUST00000035538 6630 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
RTRAFQ9CQE8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Lor-201ENSMUST00000058150 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Gm16148-201ENSMUST00000119653 893 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Bend3-202ENSMUST00000167488 6337 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.19■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Sh3glb2-203ENSMUST00000113620 1694 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Amigo1-203ENSMUST00000106659 1360 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Psip1-203ENSMUST00000107215 1898 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.17■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Hrh3-208ENSMUST00000171736 906 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
RTRAFQ9CQE8 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.8 ms